El “Mercado Amarillo” tiene su origen en tiendas de campaña y frutería construidas por el gobierno de la Provincia de Santa Catarina, probablemente a finales del siglo XVIII. Estos puestos de venta y frutería se alquilaron por pequeños comerciantes. El alquiler fue recibido primero por el gobierno de la capitanía, y después de la independencia de Brasil, el gobierno provincial de Santa Catarina.
El mercado público fue el lugar donde los pequeños comerciantes de la isla de Santa Catarina, y cerca de la costa (San José y San Miguel), venta de pescado, carne en conserva, frijoles, arroz, yuca, verduras, medicamentos, alimentos recién preparado, entre otros productos.
Entre todos esos productos se vendían esclavos. Los principales clientes del comercio eran, marineros, soldados, viajeros y la población local en general.
En 1838, el gobierno provincial autorizó la construcción de una plaza del mercado, entre calles Livramento y Defensor del Pueblo.
Dos grupos políticos locales participaron en el concurso para la elección de la ubicación del Mercado Público, “Mercado Amarillo”. Por un lado, los grandes comerciantes locales querían que las tiendas se encontraran muy cerca. La razón era que la ubicación de los puestos de venta y tiendas de comestibles atraer clientes a sus tiendas, que estaban en el comercio de la calle.
La mayoría de estos grandes comerciantes tenían familia en todas las hermandades religiosas que se encuentran en la isla de Santa Catarina.
El otro grupo político fue formado por las personas que viven en otras partes de la isla, desde otras provincias o incluso de otros países. Muchos pertenecían al grupo Concordia masónica, y la Sociedad Patriótica, ambos fundados por Jerome Coelho en el Exilio. Querían instalar las tiendas de campaña y frutería fuera de los límites de la ciudad.
En 1845, la visita de Don Pedro II y el obispo de Río de Janeiro dirigió el Consejo de exilio para aprobar el cambio de lugar de los puestos de venta y frutería. El centro de la ciudad ha sido desinfectado, y los puestos fueron trasladados a la cercana Largo de Santa Bárbara, fuera del perímetro urbano.
Por último, el primer edificio del mercado público fue construido en 1851, se encuentra junto al mar. El 5 de febrero de 1899, el edificio fue trasladada a su ubicación actual con una sola ala.
La segunda ala finalizó su construcción el 24 de enero de 1931, construido sobre un relleno sanitario, así como los puentes de conexión y el tramo central. El conjunto arquitectónico tiene su configuración actual desde 1932, con la reapertura de la primera ala.